Od 12. ledna 1942 se vila Tugendhat stala majetkem Německé říše. Od roku 1942 zřejmě až do začátku roku 1945 byl dům pronajat Walteru Messerschmidtovi, řediteli Klöcknerwerke v Brně, který zde měl byt a kancelář. V tomto období proběhly první zásadní stavební úpravy (zvýšení komína, zazdění mléčného prosklení vstupní haly a průchodu na horní terasu).